在台南科學園區內，共進行了道爺，五間厝、三抱竹、北三舍、五間厝北地點、南關里、右先方及石頭埔等八處地點的考古搶救發掘。出土的遺物包括有陶器、瓷器、石器、貝器、鐵器、各式的生態遺留等。而其涵蓋的年代從三百年前的漢人文化層、一千五百年至兩千年前的蔦松文化層，兩千五百年至三千年前的黑陶文化、三千五百至四千年右右的牛稠子文化，到最早的距今四千五百年的大坌坑文化皆有所見，其中在奇美電子LCM廠區地表下7公尺的南關里遺址所出土者，即屬於園區最早的大坌坑文化遺留。此一完整的文化層序在台灣考古學中是極具意義的。

台南科學園區跨曾文溪和鹽水溪之間，堆積迅速，其中奇美電子第二廠(LCM)內南關里遺址發現有現今台灣最早的米粒和狗骨，而道爺遺址內之舖陶群墓葬是台灣考古遺址中中少見的葬法；而從右先方的牛稠子文化延續至大湖文化中的北三舍、三抱竹、五間厝北、北三舍等遺址中所出土的甕棺，在質與量上皆是台灣考古中最豐富的。另外五間厝址出土有五百年左右的西拉雅文化遺留，也是現今有關原住民物質文化遺留最直接的證據。我們認為台南科學園區無論在科技，文化及自然生態上都其有優越的條件，不但在嘉南地區的考古有其特殊意義，在整個台灣考古上也有其重要的地位。